Catégorie : Recrutement

– Viroscan3D recrute un(e) Technicien(ne) Biologiste spécialisé(e) en NGS

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Technicien(ne) Biologiste spécialisé(e) en NGS

Notre équipe s’enrichie, nous recrutons un(e) technicien(ne) spécialisé(e) en Biologie Moléculaire et Séquençage NGS. 

Type de contrat : CDD sur mission de 12 mois (poursuite en CDI probable dès l’issue de la mission)

Laboratoire : VIROSCAN3D – Ville : LYON

Nom du contact : Mailys DANIAU – Email : mailys.daniau@viroscan3d.com

 

Date de validité : Juillet-Aout 2021 – Date de début du contrat : immédiat.

Viroscan3D (www.viroscan3d.com) est une société de biotechnologie innovante spécialisée en Génomique infectieuse. Les axes d’activités de la société concernent : 1) la Recherche de BioMarqueurs pour l’identification de cibles diagnostiques ou thérapeutiques de maladies infectieuses, et ce, par des analyses de Transcriptomes, de Génomes et d’Epigénomes ; 2) l’Identification et la Caractérisation de Génomes infectieux (virus, bactéries, champignons, microbiomes, viromes), et 3) le Contrôles en biosécurité de produits biotechnologiques. La majeure partie de nos activités sont réalisées par séquençage NGS (2nd et 3ème génération), microarrays et PCR mais peuvent également inclure une activité de tri et isolement cellulaire pour des analyses de Single-cell sequencing.

Description du poste :

Nous recrutons un(e) technicien(ne) biologiste, dont le rôle principal sera de réaliser les prestations NGS de la société ainsi que le développement de projets internes à la société.

Mission :

Rattaché(e) au Responsable scientifique, vous aurez pour principales missions (non exhaustive):

– D’un point de vue expérimental : Réaliser les manipulations techniques de purification d’acides nucléiques, de construction de banques, de séquençage NGS (Illumina, Nanopore), et d’amplifications PCR,

– D’un point de vue administratif et logistique : gérer les stocks et les commandes de consommables, remplir les documents liés à la traçabilité et qualité des processus QC des protocoles de la société,

Formation, Compétences Techniques et Scientifiques requises :

Bac +2 à Bac +5 ; IUT, Licence professionnelle, Master

Expérience souhaitée

Autres Compétences :

Biologie Moléculaire, génomique

Qualités nécessaires : rigueur, méthode, ponctualité, dynamisme, organisation, relationnel adéquat  pour interactions avec l’équipe et la hiérarchie.

Envoyer CV + Lettre de motivation à : mailys.daniau@viroscan3d.com

– ViroScan3D recrute un(e) : Bioinformaticien(ne)

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ViroScan3D recrute un(e) : Bioinformaticien(ne) à partir d’Août/Septembre 2021

La société
La société ViroScan3D est une société de biotechnologie créée en 2012 et localisée à la Faculté de Médecine et Pharmacie Rockefeller (Lyon 8ème). Sa mission est de réaliser des prestations de génomique clefs en mains, depuis le traitement des échantillons jusqu’à l’analyse des données. La société travaille pour des clients académiques et privés. De plus, ViroScan3D travaille en étroite collaboration avec ProfileXpert, une plateforme publique de génomique spécialisée en oncologie et en single cell.

Environnement de travail
La personne recrutée renforcera l’équipe d’analystes (composée de 3 bioinformaticiens) et sera sous la direction du responsable bioinformatique. Elle travaillera sur un HPCC sous Linux et collaborera avec les biologistes (6 personnes) pour la mise en place des plans expérimentaux.

Mission
La principale mission du poste est de designer, mettre en place, maintenir et utiliser différents pipelines bioinformatiques (analyse de séquences) à thématique NGS répondant aux différents besoins de la société :

  • – analyse d’expression différentielle et d’enrichissement fonctionnelle
  • – assemblage/reconstruction et annotation de génomes (viraux et bactériens)
  • – analyse des modifications génomiques : SNP, CNV, …
  • – métagénomique

Profil

Requis :

  • – Bac +5 en bioinformatique (ou Bac +3 avec une solide expérience)
  • – expérience sur des données de séquençage de seconde et/ou troisième génération
  • – maitriser au moins un langage de programmation de haut niveau
  • – notions de base en statistiques
  • – expérience de travail sous un environnement Linux
  • – efficience dans la recherche bibliographique
  • – maîtrise de l’anglais scientifique

Optionnel :

  • – expérience de travail sur un cluster de calcul
  • – maitrise d’un outil de gestion de pipelines (Bpipe, Dagr, NextFlox, Snakemake, …) et de Docker
  • – compétences d’administration systèmes et réseaux

Contrat

  • – CDD d’un an avec possibilité de poursuite en CDI
  • – Poste à pourvoir dès Août/Septembre 2021
  • – Salaire selon profil

Candidature

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