Séquençage et analyse du métatranscriptome (RNA-seq)
Viroscan3D propose des prestations de séquençage et d’analyse de métatranscriptomiques. Procédé méthodologique qui vise à étudier le contenu en ARN d’un échantillon issu d’un environnement complexe : clinique (Expectorations, Lavages broncho-alvéolaires) ou environnemental (océan, sols, air), etc.
Nous proposons un pipeline complet de séquençage : du design de votre projet jusqu’à l’analyse bio-informatique des données. Nous vous garantissons un accompagnement absolu de vos projets, la meilleure stratégie d’analyse : nécessité ou non d’enrichir préalablement la population à analyser, meilleure stratégie d’amplification, couverture, profondeur et coût, stratégie d’analyse de données et ce quelque-soit l’échantillon : de mauvaise qualité ou en faible quantité.
Nous vous garantissons la meilleure décision pour le meilleur résultat.
Séquençage et d’analyse de métatranscriptome
Nature des échantillons traités
Acides nucléiques (ARN) provenant d’échantillons cliniques ou environnementaux.
Services
- Aide au plan expérimental
- Extraction des acides nucléiques
- Construction des librairies pour séquençage court-fragments et/ou longs fragments, quantification et validation des librairies, séquençage courts fragments Illumina en paired-end et/ou longs fragments Nanopore MinION.
- Analyse primaire des données : génération des fichiers fastq et démultiplexage
- Analyse secondaire des données : Alignement des reads sur les bases de donnée
Livrables
- Rapport d’analyse
- Données brutes de séquençage
- Tableaux des résultats