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Epigénomes et Régulation d’Expression

Epigénome : MiRNome - Régulome - Methylome

L'épigénome défini l'ensemble les changements d'expression génique et d'organisation de la chromatine, transmit à la descendance mais non codés par le génome lui-même. Ces changements peuvent concerner des méthylations de l'ADN, des modifications d'histones ou encore les ARN régulateurs dont les petits ARNnc.

Les nouvelles technologies de génomique permettent caractériser les différents mécanismes de régulation épigénétiques, dont les miRNA (miRNome), le degré de méthylation des régions CpG (méthylome) et les interactions protéines/ADN (régulome) de n'importe quel organisme connu et annoté ou non annoté.

Basée sur sa solide expertiseViroScan3D vous propose ses services d'analyse du MiRNome, Méthylome et Régulome :

  • MiRNome, incluant la détection des miRNA différentiellement exprimés, et les cibles cellulaires potentiellement associées
  • Méthylome, incluant la détection des CpG par immunoprécipitation (MeDIP) ou traitement au bisulfite (BS, RRBS),
  • Régulome, incluant la détection par immunoprécipitation des interactions protéines/ADN (ChIP).

Ces analyses peuvent être abordées à différents niveaux allant du génome entier par séquençage NGS,  micro- ou beadarrays, à un niveau plus ciblé après enrichissement de régions par capture-hybridation ou par PCR :

  • Analyse du Méthylome ou du Régulome de n'importe quelle espèce, par séquençage NGS (MeDIPseq, BSseq, RRBS, ChIPseq).
  • Analyse du Méthylome ou du Régulome d'espèces annotées, par microarrays ou beadarrays (MeDIPchip, ChIPchip).
  • Analyse ciblée de méthylations  ou d'interactions protéine/ADN par qPCR (ChIP-PCR, MeDIP-PCR).